日本肉雞的產業鏈經營模式和美國、巴西類似，大部分企業實現產業鏈一體化經營，其中養殖環節主要通過合同養殖來銜接。在日本國內，合同養殖的肉雞產量約占總量的75%。與此同時，日本國內也存在一些養殖環節內部化（即自養）的產業鏈一體化企業（類似于國內的圣農發展）。從日本國內肉雞產業鏈的演進過程來看，除了財務約束，風險分擔、提高效率和交易費用最小化等驅動因素外，肉雞主產區的重新規劃安置以及雞肉分銷體系的變遷均對日本肉雞產業鏈一體化起到一定作用。

在上世紀60年代以前，日本的肉雞養殖主要分布在消費城市的郊區。中間商從散養戶收購出欄活體肉雞后再直接出售給肉食零售商。接著，這些零售商把屠宰和切塊的雞肉出售給消費者。

在60年代以后，隨著白羽肉雞的引進，日本國內肉雞養殖生產規模大為提升，城市周邊的養殖區域開始面臨重新規劃和安置的問題。與此同時，飼料廠、孵化場開始嘗試和養殖戶進行產銷合作并開始發展成為當地肉雞產業鏈的整合者。隨著區域養殖規模的進一步擴大，產業鏈整合者為了進一步發揮規模效應，開始在養殖區域建立屠宰加工廠。和之前的活禽出售不一樣，產業鏈經營企業把經過加工處理的整雞運輸到城市，并由當地的零售商做進一步加工切塊和出手給消費者。在這發展趨勢中，日本國內的冷鏈物流發揮了一定的驅動作用。

在70年代以后，肉雞生產進一步遠離城市并重新安置在農村區域。這一變化的主要原因在于為禽養殖業配置更好的養殖資源，例如土地、勞動力，便利的交通運輸和發達的冷鏈物流等。

除了通過生產合同來銜接養殖環節的產業鏈經營企業以外，一些大型的貿易公司也開始在生產區域里建立自己的養殖場和屠宰加工廠，建立起產業鏈高度一體化的經營模式。這些產業鏈經營企業屠宰加工的活禽不僅來自于自有養殖場，部分還來源于外部養殖戶。他們把肉雞加工切割成塊并運輸到全國主要城市的超市。

日本國內一些產業鏈研究成果顯示，當養殖生產區域需要重新安置在遠離消費區域的時候，改變肉雞運輸方式以避免損失和保持產品新鮮度顯得非常必要。這一變化趨勢在推動日本肉雞產業鏈一體化的進程中曾經起到一定的歷史作用。