茄子采收后，在陰涼的室內預貯10天左右才入窖，否則易出現爛果。入窖前用濃度30～40微升/升的2，4-D或50～80微升/升防落素等噴灑果柄，以防果柄脫落。貯藏時，在窖底鋪6～7厘米厚的干沙土，以調節窖內濕度。在靠窖墻周圍，用葦稈等材料圍好。在窖兩側由里向外堆碼茄子，在窖中間和兩端留出空地，以便人員進出和管理。圓茄貯藏時，第一層茄子果柄向下埋入沙中，第二層茄子果柄向上，第三層茄子果柄應與第二層茄子的萼片相接觸，以免刺傷果面。每層兩側邊緣的茄柄向外，逐層碼放3層。若茄子較小，可碼放4層。長茄貯藏時，按頭對頭、尾對尾方式碼放。茄子碼放好后，上面蓋一層牛皮紙或報紙，再蓋塑料薄膜或蒲席，以保持濕度，并防止通風時直接吹及果面。

茄子貯藏的適宜溫度為10～12℃，空氣相對濕度為95%。貯藏初期，外界氣溫較高時，應根據窖內的溫度、濕度適當通風。外界氣溫較低時須做好防寒工作。